卡片机拍照成像的优点是：能自动对焦、且像素分辨率一般更高，但其成像需要3～4秒的时间。由于扫描成像的光线均匀度远远高于拍照成像，为获得高的成像效果，以便实现“傻瓜式”分析。扫描成像的另一优点是：成像分辨率可调，菌落计数仪价格，单平皿成像可达4800dpi（即：25.4/4800=0.00529mm/像素），是任何拍照成像远不及的。可以预期：扫描成像将很快成为主流选择。
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